Weißenseifen liegt auf den Gemarkungen von drei Ortsgemeinden sowie zwei Landkreisen. Zu Hersdorf gehört der westliche Teil der Siedlung, zu Wallersheim der nördliche Teil und zu Mürlenbach der östliche Teil. Weißenseifen liegt auf einer bewaldeten Hochebene über dem Kylltal. Weißenseifen liegt zudem an der alten Römerstraße Trier-Neuss.